Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl4Q9D8E6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpl4Q9D8E6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms