Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx20Q9D2Y5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx20Q9D2Y5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms