Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CactinQ9CS00 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CactinQ9CS00 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CactinQ9CS00 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms