Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms