Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdxdc1Q99K01 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdxdc1Q99K01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdxdc1Q99K01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms