Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata4Q8K3V1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata4Q8K3V1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms