Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nupl2Q8CIC2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nupl2Q8CIC2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms