Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spock3Q8BKV0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock3Q8BKV0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock3Q8BKV0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms