Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc27Q80YS5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc27Q80YS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Lrrc27Q80YS5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Lrrc27Q80YS5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Lrrc27Q80YS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc27Q80YS5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms