Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27Q6ZWU9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27Q6ZWU9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps27Q6ZWU9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps27Q6ZWU9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps27Q6ZWU9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms