Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fhod1Q6P9Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fhod1Q6P9Q4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms