Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B4galnt3Q6L8S8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4galnt3Q6L8S8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4galnt3Q6L8S8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms