Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NipblQ6KCD5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NipblQ6KCD5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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