Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf260Q62513 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Znf260Q62513 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf260Q62513 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf260Q62513 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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