Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtafrQ62035 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtafrQ62035 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms