Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim25Q61510 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim25Q61510 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms