Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gbp4Q61107 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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