Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkaa1Q5EG47 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Prkaa1Q5EG47 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkaa1Q5EG47 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms