Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu2Q3U308 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms