Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bop1P97452 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms