Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfn1P62962 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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