Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc1a3P56564 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms