Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn1bP46414 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms