Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl28P41105 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl28P41105 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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