Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif3aP28741 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kif3aP28741 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms