Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc6a9P28571 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms