Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna1P26231 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna1P26231 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms