Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxb3P09026 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxb3P09026 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxb3P09026 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms