Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01736 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01736 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01736 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01736 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01736 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01736 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01736 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01736 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01736 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01736 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01736 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms