Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
JtbO88824 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
JtbO88824 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
JtbO88824 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
JtbO88824 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JtbO88824 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
JtbO88824 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JtbO88824 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JtbO88824 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
JtbO88824 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
JtbO88824 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
JtbO88824 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JtbO88824 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JtbO88824 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JtbO88824 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JtbO88824 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms