Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dll3O88516 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dll3O88516 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms