Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-ObO35424 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-ObO35424 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms