Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcns1O35173 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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