Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r194J3JS27 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r194J3JS27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms