Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r67G5E8C1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms