Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5218F6YH22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5218F6YH22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5218F6YH22 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms