Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r238E9Q373 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r238E9Q373 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms