Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hbb-bh2B2RVB7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hbb-bh2B2RVB7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms