Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprbB2RU80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms