Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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