Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pus1Q9WU56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pus1Q9WU56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms