Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept6Q9R1T4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept6Q9R1T4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept6Q9R1T4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept6Q9R1T4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept6Q9R1T4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept6Q9R1T4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms