Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bcl11aQ9QYE3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcl11aQ9QYE3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bcl11aQ9QYE3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcl11aQ9QYE3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms