Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfmbt1Q9JMD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms