Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk1Q9JLM8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk1Q9JLM8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms