Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpbpQ9EQI5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpbpQ9EQI5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PpbpQ9EQI5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PpbpQ9EQI5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms