Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a1Q9EPE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp13a1Q9EPE9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms