Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r50Q9EP51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r50Q9EP51 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms