Protein–RNA interactions for Protein: Q9D746

2310034C09Rik, RIKEN cDNA 2310034C09, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310034C09RikQ9D746 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
2310034C09RikQ9D746 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
2310034C09RikQ9D746 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms