Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UvssaQ9D479 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UvssaQ9D479 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UvssaQ9D479 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UvssaQ9D479 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms